L'azienda nasce come ditta individuale negli anni '60 per distribuire prevalentemente fitofarmaci (per 39 anni ha rappresentato ICI Plant Protection in Sicilia). Nei primi anni '70 diventa Spa e realizza il primo stabilimento, e inizia la produzione di fertilizzanti speciali. Si deve alla Pavoni&C Spa l'introduzione in Sicilia di fertilizzanti, oggi molto in uso, come il Potassio Nitrato, l'Urea Fosfato e il Nitrato di Magnesio, e la diffusione di formulati NPK solubili per la fertirrigazione e la concimazione fogliare (il Nu-Zim è ancora oggi il fogliare più utilizzato sugli agrumi). Da molti anni Pavoni&C Spa è leader in Sicilia nella produzione e vendita di fertilizzanti speciali e uno dei protagonisti del mercato italiano. 
Nei primi anni 2000 viene inaugurato un nuovo stabilimento per la produzione di fertilizzanti speciali, granulari e idrosolubili considerato tra i più moderni in Europa.
L'azienda si espande bene su tutto il territorio nazionale e comincia una marcata attività in molti paesi esteri, soprattutto nell'area del bacino del Mediterraneo. Nel 2006 si conclude l'esperienza Fertchem che aveva dato origine ad una proficua partecipazione - insieme ad una nota multinazionale - in un'importante azienda italiana del settore. Nel 2007 la Pavoni&C Spa perfeziona l'acquisizione di una quota di maggioranza della prestigiosa Arpa Speciali Srl di Mantova, società che da parecchi anni si occupa della distribuzione di fertilizzanti speciali avendo inoltre ottenuto l'esclusiva per l'Italia del richiestissimo "Solupotasse" della multinazionale Tessenderlo.
Pur mantenendo la propria indipendenza organizzativa, riteniamo che Arpa Speciali non mancherà di produrre sinergie con la nostra azienda che ci consentiranno complessivamente di raggiungere interessanti quote di mercato nel settore dei fertilizzanti speciali in Italia.